ج سوم نظری همتی بخش اول از فایل

0:06

Kapitul 1: این بلست کردن ما تو NCBI داریم تو یونیپروات هم داریم یونیپروات چونه اینکه رو پروتینه شما ها رو پروتین بلست میکنید اما توی نسی بی آی دیدید بلست نوکروتاید داره، بلست پروتین داره و در باید دستون واستر آنها تو خدومش باید مثل پروتینه بریم یونکروت یا بزنیم نسی بی آی نه شما فیلم با نسی بی آی نسی بی آی نسی بی آی بچه ها خیلی کارگوش هاست خیلی تواناییهاش بیشتر از یونکروتر خب حالا الان تو بحث مدل سازی می خواهم بهتون بگم ما ناچارم باید با نسی بی آی کار رو کنیم به حاطر بعد یه چیز دیگه یه بار انجام دادید یه قسمتی که پروتیل آوردیم. 208s · Speaker 1

این بلست کردن ما تو NCBI داریم تو یونیپروات هم داریم یونیپروات چونه اینکه رو پروتینه شما ها رو پروتین بلست میکنید اما توی نسی بی آی دیدید بلست نوکروتاید داره، بلست پروتین داره و در باید دستون واستر آنها تو خدومش باید مثل پروتینه بریم یونکرو…

3:35

Kapitul 2: ای که من گفتم؟ برای طبی پرایگر نه نه نه من درماز فیلم پرده این به نظره تو کجا بهتون گفتم توی درباق خلال صحبت ها هم گفتم که اینکه مثلا اگر دو ستاره باشه با تک ستاره باشه یا در آقای این زنخیتی نداشته باشن امیناسیدهایی درباون دارگه چی کمکی به مون میکنه؟ اون چیزی که تعریف می کنیم آیا مربع به اون موجودمون هست یا اگر اثرش روید؟ بچه ها نها کنید من گفتم مثلا شما میبینید به عنوان مثال میگن یه موجودی توالیش به یه موجودی متفاوته اما از لحاظ کارای اون پروتین هیچ کارایش تفاوت بدن نکرده چرا؟ چون اون آمینه اسید موجود در اون جایگاه مثلا ما جایگاه 20 شماره 20 رو بگیم با یک امیاسی در جایگاه بیست هشره ی دیگه جا به جا شده که اینا از کاز انداز بابا پوریزی با هم مشابه هم و در نتیجه موقع فوردین یا تاوردگی این آنچنان اختلال ایجاد نمی کنه تو کار پروتین نکته به اینه یعنی در حاقی اینکه ما میگیم مثلا جایگاه حفاظت شده هست یا نیم حفاظت شده هست یا نسبتا ما حفاظت شده است یا اصلا حفاظت شده نیست و متفاوتن که اینه که تو فللینگ به ما کمک می کنه که بتونیم تفصیل بکنیم که آیا این آمینازیت ها در آیا این پروتین ها که در یه سیدی از جایگاه ها با هم دیگه تفاوت دارن آیا در مرد میتونن فللینگ مشابه از خودشون گروز بدن یا نه فللینگشون اصلا کاملا متمایده که این برگرده به خاطر چیم اون همین از این هایی که خیلی نبایی کانزه رو بسن که اینا هر چقدر چه باحت داشته باشن میتونیم امیدوار باشیم که عمل کردشون عمل کرده یک سانی باشه خب حالا با این اونسا من برمی کردم در واقع روی اون موزی که خانوم فیاضی اشاره داشتن ما بچه ها چیزی که گفتیم هلیکوبرپا بودی درسته؟ نه بچه ها تمنیل کردید؟ آره آخردم تو نگلی رسیم باید بفرستدن؟ نه نه، حالا فرستدن هم بفرستدید که بقیران من باید تمنیل ها چیز بکنم یعنی من نگفتدم بفرستید ولی ارسال بکنید آره در او بهتر از که من در او اگر یا اینکه خودتون تمنیل کردید من بدونم چون من بچه ها الان یه بار بیایم تمنیل میخوام دارید چون ما تهی رونت پیش میدیم خب؟ الان من یه سری دپسگرار رو میخ اگر شما تمنیم نکرد باشید من متوجه میشم تمنیم نکردید. 303s · Speaker 4

ای که من گفتم؟ برای طبی پرایگر نه نه نه من درماز فیلم پرده این به نظره تو کجا بهتون گفتم توی درباق خلال صحبت ها هم گفتم که اینکه مثلا اگر دو ستاره باشه با تک ستاره باشه یا در آقای این زنخیتی نداشته باشن امیناسیدهایی درباون دارگه چی کمکی به …

8:39

Kapitul 3: 23 تا 2054 پس یعنی از 18 تا 22 چی ها میفیزیم؟ نایی پروپیبت هایی بره درست شد؟ ما اینجور تفسیلی کردیم که عملا اینجا هیچده تا ۱۰۰۰ شامل دامنین هستی از یعنی بدون سیگنارپپتایگ پس در واقع از ۱۰۰۲ هم که گفته اینجا چون از ۲۰۳ شروع کرده یعنی مچور پروتینمون از ۲۰۳ شروع میشه ۱۰۰۲ هم عملا نمون پروپپتایگ دونه از پس نایی پروپپتیده این ۱۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰۰ خب این پس از نکاتی بود که جلسه قبلی خدمتون اشاره کرد اما من جلسی غربی و چایی موضوعی رو خدمتون اشاره کردم خب شما تیویسی نزدید بینید؟ هرچی که ببینید تو باید که تیویسی برگزنید آره آره ما یه در واقع سرش عمومی انجام دادیم و در بین داده های هجیم، خروجی های نتیجه زیاده سرشتون گیر افتادید در منم خوب درستم درست شد؟ حالا خیلی باید بچه ها خدمتون اشاره کردم که دلکت داشته باشید صلیحیم در مسائل تا رو میگم اون رو ران کنیم برنامار رو و یه سیفرون رو کدا رو بهتویسیم اونجا خیلی این وضعیه مهم جلوی رو میکنم خب اما ما جلسی غربی چی گفتیم؟ گفتیم که ما دو تا اسطلاح داریم یه identity داریم که گفتیم یک ثانیه و یکی هم سیمیناریتی داریم چه باید که؟ گفتیم که در بومت م. 133s · Speaker 2

23 تا 2054 پس یعنی از 18 تا 22 چی ها میفیزیم؟ نایی پروپیبت هایی بره درست شد؟ ما اینجور تفسیلی کردیم که عملا اینجا هیچده تا ۱۰۰۰ شامل دامنین هستی از یعنی بدون سیگنارپپتایگ پس در واقع از ۱۰۰۲ هم که گفته اینجا چون از ۲۰۳ شروع کرده یعنی مچور پر…

10:54

Kapitul 4: سیمیلیاری سند بیشتر مشه آیدنتیتیه یک ثانی یک خو کمتر خمم اونتر حالا باشیم، دقیقا س باید بزرگتر از�� آی باشه دیگه، خب سیمیلیاریتی باید بزرگتر از حالا ما در واقع ویب سروری رو داریم اینجا خب؟ شما بچه باید باید این رو وارد کنید دیگه با اینفونماتیکس البته فکره هم یک کاری بکنید بچه ها. 67s · Speaker 4

سیمیلیاری سند بیشتر مشه آیدنتیتیه یک ثانی یک خو کمتر خمم اونتر حالا باشیم، دقیقا س باید بزرگتر از�� آی باشه دیگه، خب سیمیلیاریتی باید بزرگتر از حالا ما در واقع ویب سروری رو داریم اینجا خب؟ شما بچه باید باید این رو وارد کنید دیگه با اینفونما…

12:02

Kapitul 5: و خبه. اومدید شما کنوم رومیو بچه ها درستانی؟ خوب بچه ها نا کنید پس این داره میدید که شما اگه توالی های داشتید چند تا توالی؟ پنشتا، ده تا، ست تا داشته باشید من این ها رو یک پیگ با هم مقایس نمی کنم و میگه میزان مشابت یک سان اینا به چه سوی هست خوب الان خودش بچه ها بگه توالی این رو گذاشتی اینجا نامایی چون پول بود، تیمپلیت گذاشتی اینجا یه دونه دیگه اینجا گذاشته دوتا بعد یه دونه دیگه هم گذاشته سه تا سه تا گذاشته بگه شما با امان آرگو میتونی با امان مثلا میتونی صحبیت بکنی با خوروژی از دقیقه آشنا بشید با خوروژیش آشنا بشید خوروژی شما ها کنید بچه ها میگه میزان identity مثلا یکی از اینا با اون یکی چون سه تا بودن میگه اما هم سه تا رو اومده با هم بایستگرد میگه در واقع پنجا هفته سیمیلارتی پرسنتش هفتاده. 264s · Speaker 6

و خبه. اومدید شما کنوم رومیو بچه ها درستانی؟ خوب بچه ها نا کنید پس این داره میدید که شما اگه توالی های داشتید چند تا توالی؟ پنشتا، ده تا، ست تا داشته باشید من این ها رو یک پیگ با هم مقایس نمی کنم و میگه میزان مشابت یک سان اینا به چه سوی هست…

16:26

Kapitul 6: خب همون علامت و یک رو ایجوری بد بزنی برای علامتی یک یعنی چی؟ علامتی یک آفرین این دیگه باید در واقع علامتی یک خیلی بیشتا دیگه یه شما دیگه باید آر فستیشو باید بردارید چون چه رابط چه آر فستی باید بردارید؟ چون اینجا شما دارید ویب سرور دستوی میدید که بیاید این سه تا تا تاواله با همدیگه میزان آیدنیتی و سمیلار چون مشخص بکن اون ویب سرور بدبختی بیچاره از کجا متوجه بشه که این تاوال پس برای این قضیه ای که به اون حد تصور رو فهمونده که بدیم ما باید از عنامت فسته استفاده بکنیم خب این یک درست شدت؟ حالا دو همی رو من میرم اینجا سرش بکنم باز بتونن اکسیجن نامر دو همی هم میرم این هم اچه ها اکسیژن نامبر دوبومی این توالیه رو بچه ها چیکار بکنید یه لحظه اینجا دقیقت بکنید بچه ها که این هم همیشه سیف داشته باشه دیگه نمیخواد نیاز به انسی بیایی داشته شد دقیقت بکنید توی کوشی بیانفروماتیکه در یک نطفت باز کنید بچه ها در اول تکس باز کنید تکست دایگیومنت باز کنید اینجا درست شد؟ تکست دایگیومنت باز کنید توی کریکه راست بکنید در خانون دشتست ورگ بایش کار ندار هرچه. 129s · Speaker 1

خب همون علامت و یک رو ایجوری بد بزنی برای علامتی یک یعنی چی؟ علامتی یک آفرین این دیگه باید در واقع علامتی یک خیلی بیشتا دیگه یه شما دیگه باید آر فستیشو باید بردارید چون چه رابط چه آر فستی باید بردارید؟ چون اینجا شما دارید ویب سرور دستوی مید…

18:35

Kapitul 7: حالا میاوریه هلیکوبرپا تیلیپسین بچه هلیکوبرپا تیلیپسینشو بچه ها بیا این دویس تنجا چهار تا یه رو وارد بکنید یعنی این اکسیژن نامبر رو اولی نبو؟ نه نه اولی نبو بچه اینا این رو وارد بکنید ایکس بی آندر لاین سفت بیس و یازده هشتاده هفصده پنجا نوم داد سه این هلیکوبرپا همی جرا تیلیپسین حمله چه شد؟ گفتم ناخو اکسی جنابهش اتونستش بزنی که اینم به دست بیاری؟ تر نمیشون از تخواب دردم؟ چار رو میشون آره میتونی چار رو میشون بود و اگه اتخای باید ببین تای ببینید تا چار رو میشون انتخاب بکنیش استرالی بازید. 66s · Speaker 3

حالا میاوریه هلیکوبرپا تیلیپسین بچه هلیکوبرپا تیلیپسینشو بچه ها بیا این دویس تنجا چهار تا یه رو وارد بکنید یعنی این اکسیژن نامبر رو اولی نبو؟ نه نه اولی نبو بچه اینا این رو وارد بکنید ایکس بی آندر لاین سفت بیس و یازده هشتاده هفصده پنجا نوم …

19:44

Kapitul 8: نه یکیوه پا اول انتخاب کرده؟ نه یکو به پا اول انتخابه اکسیجن های ما رو شداده. 155s · Speaker 1

نه یکیوه پا اول انتخاب کرده؟ نه یکو به پا اول انتخابه اکسیجن های ما رو شداده. چارو می رو انتخاب کرده. ببینید 254 آمین هستیده و چوتونش نه پروتینش مهمنی پروتینش رو بزرم زیر خود شیشتی بذاره این چهارونیه سویه یه گذینه پروتین دارم خب پروتین بچها…

22:19

Kapitul 9: تیرپسینش رو بزنم برای ملوژی ها کدومش رو گرفتی من مخوام پروتین شاغ رو در کدوم برد کدوم برد کدوم برد کدوم برد کدوم؟ بچه ما… 108s · Speaker 5

تیرپسینش رو بزنم برای ملوژی ها کدومش رو گرفتی من مخوام پروتین شاغ رو در کدوم برد کدوم برد کدوم برد کدوم برد کدوم؟ بچه ما اصلا پروتین نو پروتین هستیم پروتین رو زدن، پروتین رو زدن، پروتین رو زدن، پروتین رو زدن، پروتین رو زدن، پروتین رو زدن، پ…

24:08

Kapitul 10: تیرپسی میکوزایی مثال اسیسپرم که تو کلوشن روش شما، اصلا، مثلا، حالت فسته بذار، اصلا دو خط قسم باشه، مشکل نداره این همه گو… 85s · Speaker 1

تیرپسی میکوزایی مثال اسیسپرم که تو کلوشن روش شما، اصلا، مثلا، حالت فسته بذار، اصلا دو خط قسم باشه، مشکل نداره این همه گورده تو، مقدر تو سیل بکنی، داشته باشید، پاک ایشن نکنید خب، تمام میخوانو پریزید خب، بچه ها، نا کنید نکته از اینجا اگه تمام…

25:36

Kapitul 11: همون نواهی مرمو خودتان چی؟ خب نه نه الان این گلگوه گلگویی که خودش گذاشتم بود خودش گذاشتم آره درشان چیه غذیهش؟ شما درشان میبینید یاد چی باید بیافت ذهنه تون به کجا میره؟ هرناهی کروموتونو نه سیگناتری بکنم الان شما سه تا طبالی گرفتی، یک هشتی بیس و شسویک آمیناسی بود، یک هشتی بیس و چلاش آمیناسی بود، یک هشتی بیس و چلاش آمیناسی بود، یک هشتی بیس خنجا چهار بار، از روز یک حضورتی دارن میگم خب نرم فکرم این مثلا با این چیزی که من گفتم و این روی که خودش سامانه ویب سر ویب رو داشته این عذیرش چیه بس؟ چماز شده؟ آره برای تو خیلی نفازه شده؟ برای تو خیلی نفازه شده؟ برای تو خیلی نفازه شده؟ فقط آورده گرفته؟ یه اشاره ایتا اول نسیمونی میدارید شما تو پاسا بود به صحابه من دارید چی؟ دوباره باید دیگرم اون چشم اومده بچه ها میگه من برای اینکه بخوام کاری رو ران بکنم انجام بدم شما وقت فایلاتون رو الائیمند شده همتراز شده با هم در من بفرستید با بکنون دشت ها به خاطر اینه این 248، 254، 261 رو اول باید بریم توی یه سامانهی توی یه ویبسر بریم همقدر بکنیم، همترازشون بکنیم بعد بیاییم بذاریم اینجا وقتی شما همتراز نیکنیم چون اینو همقدر میستن دیگه دشت میاد بسید کار پس در واقع این فایل این چیزی که نتیجه که میبینید اینجا این فایل همترازی شده یه طوالی های مختلفه خب پس من برای که بخواهم تیز کنم میانم کلاستالW بچه ها کلاستالW میانم توی در واقع سرشی که میانم کلاستالW میانم توی در واقع جنومJP شما قاعد کلاستالW رو بزنید بچه ها کلاستالW بدون این اول جنومنت نوشته جنومنت نوشته که آدرسش جنومJP . 202s · Speaker 5

همون نواهی مرمو خودتان چی؟ خب نه نه الان این گلگوه گلگویی که خودش گذاشتم بود خودش گذاشتم آره درشان چیه غذیهش؟ شما درشان میبینید یاد چی باید بیافت ذهنه تون به کجا میره؟ هرناهی کروموتونو نه سیگناتری بکنم الان شما سه تا طبالی گرفتی، یک هشتی بی…

28:59

سه چرا من یک کار کردن یک رو بازه؟ کجار رو اشتباه کردن؟ کجار رو اشتباه کردن؟ باید ببینید اعتمال باید مثلا فصله ای نبوده باشه توالیتون یکی از توالیاتون نه باید این حال به توالیتون یا اینکه اصلا یک توالیت خیلی بود یا باید یکش نوکلوتیدی باشه ات…

30:07

Kapitul 13: آره دیگه. 301s · Speaker 3

آره دیگه. این را همیشه داشته باشه. این را همیشه داشته باشه. این را همی کرده. خب. بزن دیگه. چی شده؟ خب بیا اتا بگیرد. میگی که فرمتش دو شما ماشید اینگه بگیرد. این که یکیش رو بگیرد. بایست بایست بایست نه نه اوکی از اون بولا را کنم دیگه بایدارم …

35:08

Kapitul 14: بکنیم به من اون موقع میگی که میزان آیدنسیم و سیمی داره تیه تنوالی هم به چه صورت داره؟ ما را هم این کارو انجام بدیم یعنی … 87s · Speaker 2

بکنیم به من اون موقع میگی که میزان آیدنسیم و سیمی داره تیه تنوالی هم به چه صورت داره؟ ما را هم این کارو انجام بدیم یعنی بازاریم روش باید کپی بزاریم برقم این پی آی آی آ را نا نکته نکته بچه ها این ستاره میبینید اینجا خراب میکنه این ستاره هایی…

36:35

Kapitul 15: کلاس خون اومدن بیرون خودش نسال و خودش برای آرد شدن کلیه رو زنید باز نمی کنم برای آیده دیگه آیده دیگه آیده دیگه چیز دیگه دادی بخواییم بزنیم؟ اومد نتیجه تو خب برقا که شد نتایجو برون نیزانه؟ اولی شد آده دیتی رفته سی و چهار سمیلارتی پنجام دو بعدیش آیدنتیتی پنزد سمیلارتی سیدیک بعدیش به آخری توادیه آیدنتیتی نوزده سمیلارتی سیدیک بس شدید بس شدید از کلاستان اومدم بیروند خب چی شد؟ این درسته. 222s · Speaker 5

کلاس خون اومدن بیرون خودش نسال و خودش برای آرد شدن کلیه رو زنید باز نمی کنم برای آیده دیگه آیده دیگه آیده دیگه چیز دیگه دادی بخواییم بزنیم؟ اومد نتیجه تو خب برقا که شد نتایجو برون نیزانه؟ اولی شد آده دیتی رفته سی و چهار سمیلارتی پنجام دو بع…

40:18

Kapitul 16: چی بود تا چه؟ به معنی بقایی هاست با همونده نه خب بکره بچه ها با کنید ده اسید آمینه هایی که پیه پروتیین میرن، طبال پروتیین نقشیفا میکنن میگن ریزیدیو همون واژیف همون موسیقی درست گفت، باقی مانده بهش میگن وقتی اسیدان میگن، مثلا اسیدان می یه سلین داریم سلین وقتی رفت تو طبال پروتیین مراکلی پیش میگن ریزیدیو اولا نا کنید بچه ها اینجا چی گفته؟ گفته identical residues باقی مانده ها یا همون آمینسید های میشه اینجوری بدون باقی مانده های آدنتیکال چند تا هست دیگه سفت و دو نمت هست یعنی بگر از این هایی که گفته شو واقع داره کنون باقی ماندهش میگید؟ نه به آمینسید به هر آمینسیدی وقتی میرید تو در باقی پروتین قرار بگیر بگیر یا ریزیلیو محضوع هر جا ریزیلیو دیدید این همون آمینسید درست شو؟ آه این مال خودشه این مدر من بهتون از ویس اول وقت من سعی میتونم فقط ریل گذاری بگونم اصلا این چیزی که من انجام نباشت ما حتما نبارد فقط اگر درست ران کرده میشید اوکی آره پس در واقع اینجا پرسنت در واقع آیدنیتی رو میگه پنج و هفت مثلا پرسنت آید سیمینایتی رو میگه هفتا الان خب چند در آوردیم شما؟ تبیتا باید هم باید مثل هم باشید دیگه تو تباییتون یکی بوده و الاخر. 301s · Speaker 4

چی بود تا چه؟ به معنی بقایی هاست با همونده نه خب بکره بچه ها با کنید ده اسید آمینه هایی که پیه پروتیین میرن، طبال پروتیین نقشیفا میکنن میگن ریزیدیو همون واژیف همون موسیقی درست گفت، باقی مانده بهش میگن وقتی اسیدان میگن، مثلا اسیدان می یه سلی…

45:20

Kapitul 17: که بدونید دیگه هر جا دشت دیدید، چند توادیدید برنید و این نرکبوشی همترازید، الان میری مدرم شده خب، این پس از این موضوع اما بچه ها ما بعد از این موره می رویم به یک سری web server هایی که به ما کمک می کنه در تفصیل عملا محتوی ساختار اول و دو گوم توالیه خاصی که داریم خب یکی از ما بچه ها پارات بارام هست بریم شامل چه شیست های اصال الان که هم انجام بودیم متوجه میشیم قضیه چیه؟ پروت پارم بچه هم. 130s · Speaker 2

که بدونید دیگه هر جا دشت دیدید، چند توادیدید برنید و این نرکبوشی همترازید، الان میری مدرم شده خب، این پس از این موضوع اما بچه ها ما بعد از این موره می رویم به یک سری web server هایی که به ما کمک می کنه در تفصیل عملا محتوی ساختار اول و دو گو…

47:30

Kapitul 18: آره من خانم اینجا باید یه دونه بیشت نمیتونی باره بکنی یه دونه باید کنیم بعد گزینه کامپیوت رو میتونید برسته بله باید کامپ… 26s · Speaker 4

آره من خانم اینجا باید یه دونه بیشت نمیتونی باره بکنی یه دونه باید کنیم بعد گزینه کامپیوت رو میتونید برسته بله باید کامپیوت پرامیترز توالی احتمال فستی بارد کرده احتمال نمیزه توالی احتمال نمیزه توالی احتمال نمیزه ما فستی نمیزه

Speakers

Kapitlar