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Лектори

• Speaker 1 5:00

1. 5:00

   Глава 1: ci soffermeremo sugli approcci che vengono utilizzati per le malattie genetiche non considerando i tumori, perché la chiamata delle variate dei tumori è molto più complessa e quindi a meno per quest 'anno lasciamo la parte. 294s · Speaker 1

   ci soffermeremo sugli approcci che vengono utilizzati per le malattie genetiche non considerando i tumori, perché la chiamata delle variate dei tumori è molto più complessa e quindi a meno per quest 'anno lasciamo la parte. Allora, l 'esemp…

2. 10:00

   Глава 2: Quindi c 'è bisogno di un passaggio che è quello che viene chiamato amplificazione clonale. 300s · Speaker 1

   Quindi c 'è bisogno di un passaggio che è quello che viene chiamato amplificazione clonale. L 'amplificazione clonale, nel caso del sequenziamento di lumina, si basa sulla possibilità di costruire questi raggruppamenti di sequenze che origi…

3. 15:01

   Глава 3: Cambiate di consulmento in modo che favorisca la denaturazione che avete due pochi. 301s · Speaker 1

   Cambiate di consulmento in modo che favorisca la denaturazione che avete due pochi. E di qua la cosa diventa esponenziale. Non dovete far altro che ripetere questo ciclo, un numero fisso di volte in generale sono 35 cicli, per avere abbasta…

4. 20:02

   Глава 4: ne fate solo uno, perché io ho il mio cluster, non faccio niente altro che di nuovo rimettarmi nella condizione che ho in questo punto. 301s · Speaker 1

   ne fate solo uno, perché io ho il mio cluster, non faccio niente altro che di nuovo rimettarmi nella condizione che ho in questo punto. Ci siete con l 'idea? Faccio l 'idea. Allora, il mio problema qual è? Io ho questo pezzo di DNA e io lo …

5. 25:03

   Глава 5: Per quanto i sistemi enzimatici siano estremamente efficienti, non hanno mai un 'efficienza del 100 % sempre. 302s · Speaker 1

   Per quanto i sistemi enzimatici siano estremamente efficienti, non hanno mai un 'efficienza del 100 % sempre. Per cui, man mano scantata avanti nella reazione, rischiate di fare degli attori. e 150 rubri di tivi rappresentano il compromesso…

6. 30:06

   Глава 6: macchine moderne, riuscite a sequenziare in teoria qualcosa come un genoma ogni 4 -5 ore. 300s · Speaker 1

   macchine moderne, riuscite a sequenziare in teoria qualcosa come un genoma ogni 4 -5 ore. Il punto chiave è il fatto che voi state sequenziando tantissime sequenze contemporaneamente. Quindi siete andati al di là della problematica di Sange…

7. 35:07

   Глава 7: Perché i costi più bassi? 302s · Speaker 1

   Perché i costi più bassi? Tanto più il volume di sequenza è elevato, tanto più basso il costo per singolo ortotide. La reazione per tutti è molto costosa, ma per singolo ortotide si abbassa. Per darvi un 'idea, sempre quando è comparso ques…

8. 40:10

   Глава 8: per costruire un cerchio a singola elica. 302s · Speaker 1

   per costruire un cerchio a singola elica. Quindi quello che voi ottenete è una cosa di questo genere. Avete un cerchio, scusate, parzialmente a singola elica perché è l 'invidazione che ha tra le due sequenze conosciute in questo pezzo di D…

9. 45:12

   Глава 9: polimerasi termostatile. 304s · Speaker 1

   polimerasi termostatile. Allora, la prima cosa che fate è quando voi frammentate il DNA con la sonicazione, non avete garanzie che i frammenti siano netti. Quindi potreste avere dei frammenti che all 'esternità cito primo punto. Quindi la p…

10. 50:17

    Глава 10: da un lato e questa è la versione dall 'altro e di qua avete semplicemente la versione rigirata al contrario. 258s · Speaker 1

    da un lato e questa è la versione dall 'altro e di qua avete semplicemente la versione rigirata al contrario. Quindi di qua ho questo e di qua ho quello dritto. Ci siete come vediamo? Fondamentalmente il grosso vantaggio che ho in questo ti…

11. 1:00:01

    Глава 11: La limitazione di questo approccio, come dicevo, sono i 48 campioni. 301s · Speaker 1

    La limitazione di questo approccio, come dicevo, sono i 48 campioni. Allora, c 'è stato un problema perché ci si è accorti, specialmente sequenziando il DNA, che compariva una problematica che è collegata alle polimerasi che abbastavano. Qu…

12. 1:05:03

    Глава 12: 159 litri. 300s · Speaker 1

    159 litri. La read 2 che cosa fa? Legge l 'index 7, quello che viene attaccato alla vostra read format. Allora, le read forward e reverse si chiamano per, diciamo, convenzione R1 e R2. R1 è sempre la forward, R2 è altra. E' importante chiam…

13. 1:10:03

    Глава 13: solitamente viene sequenziato con una copertura di 30 volte, 30 per. 303s · Speaker 1

    solitamente viene sequenziato con una copertura di 30 volte, 30 per. Che cosa vuol dire copertura 30 per? Vuol dire che in media ogni singola base del vostro genoma è stato sequenziato almeno 30 volte. In genere i genomi tumorali si sequenz…

14. 1:15:06

    Глава 14: come succede nei timoni per cui probabilmente fare un 'esoma è economicamente anche informativamente quindi quello che succede in questi casi è quando facciamo un 'esoma quello che si fa è voi avete farmentato il vostro DNA con i soliti sistemi Avete costruito l 'estremità band e poi dopo che cosa fate? 303s · Speaker 1

    come succede nei timoni per cui probabilmente fare un 'esoma è economicamente anche informativamente quindi quello che succede in questi casi è quando facciamo un 'esoma quello che si fa è voi avete farmentato il vostro DNA con i soliti sis…

15. 1:20:10

    Глава 15: voi interessa sapere dello stesso frammento la sequenza inclusa all 'interno del frammento. 304s · Speaker 1

    voi interessa sapere dello stesso frammento la sequenza inclusa all 'interno del frammento. Quindi R1 e R2 sono tutte e due accoppiati già nel modo con cui vengono generati dal sequenziatore. Ci siete? Forward R1, reverse R2, sequenziate lo…

16. 1:25:14

    Глава 16: dal kit che viene utilizzato, ma fondamentalmente ci sono dei modi per sapere se la libreria vale la pena sequenziarlo o quello. 302s · Speaker 1

    dal kit che viene utilizzato, ma fondamentalmente ci sono dei modi per sapere se la libreria vale la pena sequenziarlo o quello. Una volta che, diciamo, la parte web, quella di laboratorio, funziona, bisogna anche vedere se il sequenziament…

17. 1:30:16

    Глава 17: il contenuto IGC deve essere sempre lo stesso. 302s · Speaker 1

    il contenuto IGC deve essere sempre lo stesso. Non è possibile che qualche campione abbia dei contenuti IGC con una distribuzione diversa, perché sempre il genoma UMA deve essere uguale. Quindi, FASQ, singolo camione, controllo di qualità, …

18. 1:35:18

    Глава 18: Quando spostate quel gene, tutte le altre sequenze a valle di quel gene cambiano posizione. 304s · Speaker 1

    Quando spostate quel gene, tutte le altre sequenze a valle di quel gene cambiano posizione. Di conseguenza, è importante che la notazione che state utilizzando, e per la notazione si intende anche gli sneak noti presenti nel genoma, siano c…

19. 1:40:22

    Глава 19: Vedremo un po' tutte queste cose. 300s · Speaker 1

    Vedremo un po' tutte queste cose. La prima cosa che dobbiamo vedere è come funziona Gotai, ma per prima cosa dobbiamo vedere come viene generato questo index per velocizzare la nostra attenzione. Allora, la parte iniziale che vedrete sembra…

20. 1:45:23

    Глава 20: Immaginate che ognuna delle vostre parole è un cromosoma. 140s · Speaker 1

    Immaginate che ognuna delle vostre parole è un cromosoma. Un cromosoma 1, 2, 3, 4. Quindi ogni cromosoma diventa, viene trasformato, con questo dolore che si sposta, in una nuova sequenza che è data soltanto dalla sequenza dell 'ultimo cara…